Lo primero es comentar que no sé si son IP’s públicas o privadas…

Miremos el caso más complicado:

La idea seria más o menos esta:

• Montas las protecciones oportunas en la maquina linux.
• Pasas las dos IP’s estaticas a la máquina linux. Puedes usar ipalias o dos tarjetas de red fisicas, depende de tus necesidades.
• Le pones a las dos máquinas windows una ip en un rango adecuado para una intranet.
• Usando “iptables” en el servidor linux, redirijes las peticiones entrantes hacia cada máquina, en funcion de los servicios que ofrezcas. Es decir, si te llega una petición entrante al puerto 80 de la maquina linux, se la reenvias al puerto 80 de la maquina con el servidor web para que la responda. Lo mismo para las peticiones al dominio montado en ese 2003.

Ese seria el planteamiento para el caso de que quieras tener las máquinas dando servicio a internet. Si el caso es diferente, mandanos más información.

Por cierto, ¿todavía usas Windows?…